On accède à la cour Henri IV par le portail de l'hôtel de ville qui perce la façade principale. La cour est cernée par deux galeries construites entre 1602 et 1607 sur les plan de Pierre Souffron. Ce sont les parties les plus anciennes du Capitole. La cour doit son nom aux capitouls de Toulouse qui firent ériger une statue du roi Henri IV, en remerciement de son aide financière accordée pour l'accélération des travaux, alors retardés par les membres du Parlement hostiles au projet. La statue du roi, œuvre de Thomas Hurtamat, est datée de 1607 et est placée au-dessus du portail de l'architecte et sculpteur toulousain Nicolas Bachelier. Elle est constituée d'un corps en armure noire et une tête blanche couronnée de lauriers verts placés dans une niche entre deux oculi et des blasons des capitouls. Sous la statue, on peut lire une inscription datée de la Révolution : « Vivant, le peuple entier l'aimera. Il le pleura quand il fut enlevé. La postérité ne cessera de l'aimer d'un amour pieux